rna\_majiq.GeneIntrons
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.. currentmodule:: rna_majiq

.. autoclass:: GeneIntrons

   
   .. automethod:: __init__

   
   .. rubric:: Methods

   .. autosummary::
   
      ~GeneIntrons.__init__
      ~GeneIntrons.build_group
      ~GeneIntrons.checksum
      ~GeneIntrons.checksum_nodata
      ~GeneIntrons.connect_exons
      ~GeneIntrons.dst_exon_idx
      ~GeneIntrons.filter_passed
      ~GeneIntrons.from_arrays
      ~GeneIntrons.from_genes
      ~GeneIntrons.from_zarr
      ~GeneIntrons.index
      ~GeneIntrons.is_denovo
      ~GeneIntrons.overlaps
      ~GeneIntrons.propagate_through_annotated
      ~GeneIntrons.propagate_to_annotated
      ~GeneIntrons.slice_for_gene
      ~GeneIntrons.src_exon_idx
      ~GeneIntrons.to_zarr
      ~GeneIntrons.update_flags_from
   
   

   
   
   .. rubric:: Attributes

   .. autosummary::
   
      ~GeneIntrons.DF_VARS
      ~GeneIntrons.IDX_NAME
      ~GeneIntrons.ZARR_GROUP
      ~GeneIntrons.connected_exons
      ~GeneIntrons.denovo
      ~GeneIntrons.df
      ~GeneIntrons.end
      ~GeneIntrons.end_exon_idx
      ~GeneIntrons.gene_idx
      ~GeneIntrons.genes
      ~GeneIntrons.gi_idx
      ~GeneIntrons.passed_build
      ~GeneIntrons.simplified
      ~GeneIntrons.start
      ~GeneIntrons.start_exon_idx